常設展示
１登拝する山（展示棟1～5階）
２荒ぶる山（展示棟５階）
広大な太平洋を囲む「火の輪」、環太平洋火山帯の一角で産声を上げた富士山は、若く活発な火山です。この荒ぶる山と人類との出会いは、およそ3万5千年前。このゾーンでは、富士山と人との出会いの物語を紹介します。
３聖なる山（展示棟4階）
富士山の美しい景色や豊かな自然の恵みが、長い歴史を通して様々な信仰を生み出し、今もわれわれ日本人の心のよりどころとなっています。このゾーンでは、富士山への信仰をキーワードに、富士山のもつ普遍的な価値を紹介します。
４美しき山（展示棟3階）
聖なる火山―富士。白雪をまとい優雅に稜線を垂下させるその麗しい姿は、古来詩歌に頌（たた）えられるとともに、絵画作品としても伝えられてきました。 このゾーンでは、美術や文学に表された富士山について、紹介します
５育む山（西棟3階）
富士山は、駿河湾（するがわん）の海底から測ると、6,000mを超える高山です。山頂の雪や雨は地面に染み込み、海底からも湧き出し、この水がさまざまな生命を支えています。 このゾーンでは、高山帯から駿河湾までの生態系を紹介します。
６受け継ぐ山（北棟3階）
富士山は、昔も今も人の心に根付き、親しまれる一方で、活動を続ける恐ろしい火山でもあります。このゾーンでは、活火山、心に根付く山、登山する山など、富士山のさまざまな顔を見ながら、人と富士山の未来を考えていきます。
※常設展示は番号の順番に沿って御覧いただくのが標準的なルートになります。
※展示解説は一部を除き日英中（簡体・繁体）韓対応。
その他
映像シアター（２階）
265インチスクリーンを備え、４Ｋ画質のプロジェクターを設置しています。
富士山を見ることができない日でも、美しい富士山をたのしんでいただけるよう、
「天の巻」：四季折々の美しい富士山の映像を見ることのできる番組
「地の巻」：世界遺産富士山の「信仰の対象、芸術の源泉」にスポットをあてた番組
「宙(そら)の巻」：人間が体験することのできない、上空からの富士山を見ることのできる番組
の３番組を上映しています。いずれの番組も上映時間は約８分間です。
シアター上映プログラムは、
毎時00分～「天の巻」、 毎時15分～「宙(そら)の巻」、 毎時30分～「地の巻」、 毎時45分～「宙(そら)の巻」となります。
環富士山マップ（１階）
世界遺産富士山の構成資産や周辺市町等が設置する富士山関連施設等を紹介しています。
受賞情報
JCDインターナショナルデザインアワード2018：大賞
第37回ディスプレイ産業賞：大賞
DSA日本空間デザイン賞2018：金賞
第52回サインデザイン賞：金賞
